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科技期刊增強出版與實現流程范文

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科技期刊增強出版與實現流程

1增強出版的本質

增強出版的核心不僅在于提供豐富的數據和自動鏈接知識,實現深度知識服務,更體現在保持傳統出版的“敘事精神”。基于此,增強型出版物可定義為增強了研究數據、額外材料、出版后數據、數據庫記錄等對象的出版物,增強對象之間具有基于對象結構的明確鏈接[3],涉及根出版物、其他數據和元數據3個實體。在此定義中,對象可以是論文或論文片段、數據集、圖像、音頻、視頻、評論、模塊或數據庫中信息的鏈接等[4]。增強出版后的科技期刊可稱為增強型學術期刊[6],其構成要素是一個必須的文本(指發表在出版物上的論文,也稱為“根出版物”)+一系列關聯附加數據。在傳統論文基礎上增加或鏈接各種必要相關數據,相關數據與傳統論文一并注冊、登記、、分享,稱為增強論文[7]。增強型出版物是連接文獻與數據的橋梁和紐帶,便于讀者發現更多的灰色文獻[5],是一種有機的復合數字作品,但構成對象可獨立存在,又可通過多種形式出版。附帶相關數據標引信息的增強論文,可按原始期刊出版方式印刷出版或在線;其增強的數據內容(增補信息)既是令論文更完整的輔助材料,也是同行評議環節使結論更可靠的輔助材料,因空間與媒介形態特質往往不能與印刷版一起出版,而是僅存放于數據中心、資料庫、網絡平臺等,以數字形式呈現,讀者可通過相應鏈接在出版論文的網絡版中進行訪問和獲取。增強出版的理念是交叉鏈接、富數據、開放共享,因此增強出版具有以下的功能:(1)滿足科研人員對學術信息獲取、傳遞等更多需求;(2)關聯并實現科學信息的完整性,延伸成果的轉化與應用,提高論文被發現和引用的可能;(3)拓展研究成果與思想表達的空間與手段,實現知識的充分交流與共享[7];(4)提高同行評價的效率和質量,保證出版的有效性和控制出版過程[4],并有效遏制學術不端行為[7](如Nature的部分圖片,可鏈接并下載圖片的原始Excel數據,防止數據造假)。

2增強出版內容及示例

2.1增強出版內容

Bardi等[1]探討了“PDF格式科技期刊論文+增強內容I(PPT、視頻、電子表格等)”與“結構化后科技期刊論文+增強內容II(圖表、視頻,數據集等)+增強內容I”的科技期刊增強出版特征。科技期刊論文結構化后變成不同碎片,可關聯更豐富的數據。結合前人對增強出版的研究和典型案例的增強出版特征,借鑒文獻[1]的“結構化后科技期刊論文+增強內容II+增強內容I”特征,筆者對科技期刊增強出版的內容進行拓展,所得結果如圖1所示。科技期刊增強出版的增補信息可以是任何能夠輔助說明論文的主要內容及與論文相關的任何類型的數據。這些數字資源從與論文的關聯方式上可分為2類,即圖1中I類與II類。I類為針對整篇論文的增強內容,如Nature中的相關新聞與評論、音視頻、編輯總結、相關論文、數據加入代碼等;Elsevier中的圖片摘要、論文亮點、相關書籍、引證論文等;PLoS中的媒體報道、讀者評論等。II類為針對論文中某知識點的增強內容,如擴展圖表、增補方法、增補表格、增補討論、增補公式、增補視頻、增補數據集(數據來源網址、數據有效性測試網址、數據庫或科研工具網址等)、相關論文推薦等。從內容上可分為研究數據、額外材料、出版后數據和數據庫記錄、工作流程、軟件、參考文獻、引用文獻、相似文獻等數字出版物[5-7,11]。從形態上分為文本、圖片、音視頻、數據集等多種數字形態。科技期刊經過增強出版后,可將研究數據、額外資料等不同形式的數據集成鏈接,幫助科研人員系統地理解研究數據及信息的產生、應用與創新過程,便于用戶快速利用資源地圖及永久標識符等在不同類型資源中(這些數字資源可能分散存儲在不同數據庫)快速檢索和定位用戶需求的資源。增強的內容要具有機器可讀、智能標記及結構化的特點,需具備關鍵詞和數字摘要。從圖1也可看出,為了更好地實現科技期刊的增強出版,首先要將科技論文結構化、碎片化,以便關聯更多相關增補信息,提高讀者閱讀體驗,更便捷地將讀者感興趣的內容分享到社區網絡,擴大論文的社會影響力。結構化論文經過碎片化標引后還可進入不同專業數據庫,成為科學領域共同體。

2.2增強出版示

例Springer-Nature、PLoS、Elsevier、Wiley等出版集團在科技論文中附加電子輔助材料的現象較為普遍,但非強制附加。以下網址為增強出版示例,增補材料和PDF增強論文均可下載。

3增強出版實現流程

增強出版基于傳統出版,是對傳統科技論文內容的增強。出版流程中不僅要按傳統的程序對科技論文進行同行評議和編輯加工后出版,還要對增補信息進行審核、存儲與。換言之,科技期刊增強出版過程是對信息包的提交、存檔與傳播過程。OAIS(OpenArchivesInformationSystems)參考模型識別出3種特殊類型的信息包,即提交信息包(SubmissionInformationPackage,SIP)、存檔信息包(ArchivalInformationPackage,AIP)、傳播信息包(DisseminationInformationPackage,DIP)[4]。提交信息包用于構建一個或多個信息包,由作者創建并提交給編輯部,編輯部接到信息包后將其轉換成存檔信息包。存檔信息包需要以一種有效的方式存儲信息,為了將信息傳播給對信息感興趣的未來用戶,存儲信息可通過傳播信息包獲得。傳播信息包是指OAIS基于用戶請求從一個或多個存檔信息包中提取出用戶需求的信息包并傳遞給用戶,該包可以是用于互操作的信息交換格式。

3.1提交

科技期刊增強出版流程中,作者將信息包提交至編輯部,編輯部對信息包內容進行審核和處理。如Nature要求作者在初始提交增補信息包時,應按編輯部要求規范提交信息包,并將論文、增補材料與增補材料清單等文件一并通過Nature在線服務器提交。當論文被接收后,規范的增補材料可在線上傳到Nature服務器。在提交資料包時論文與增補資料包應同時提交,并對增補信息做好標引,還要為增補資料提供元數據標注、鏈接描述表、每份資料注冊數字對象唯一標識符(DigitalObjectIdentifier,DOI)、碎片化標引、碎片數據聚類等信息[8]。不同類型的增補信息需按要求和規范進行標引和整理(表1)。在同行評議環節,專家可通過閱讀輔助的增強信息內容對論文進行更客觀公正的評價,但無需對增補內容進行評議,如Nature與PLoS的投稿要求均指出,增補信息無需接受審閱。論文接受后增補信息不能再修改,編輯部不負責維護增補信息中鏈接與郵件地址的信息。論文出版時,Nature將與之相關的增補信息于網站,讀者可免費獲取。作者提供的增補信息,呈現時需確保清晰、簡便,條款風格與論文其余部分一致[12],確保增補信息的可獲取性,以保護著作權、支持大數據分析、正確檢索鏈接,提高知識的易獲取性,提升閱讀體驗,促進知識共享與重用。

3.2存檔

傳統科技期刊出版僅是論文本身的出版,增強型學術期刊則要將論文(根出版物)與其他附加數字資源整合為有機的復合數字作品進行出版。因此,科技期刊增強出版需適應作者需求,對出版內容進行合理的組織與封裝,重構不同的產品封裝形態。該過程應按以下原則進行[4,6]。(1)所有內容需進行結構化處理(如XML結構化處理或基于語義的結構化處理等),使之成為有機融合的整體。將內容進行結構化處理后,各種異構的數據就可以相互關聯,且具有明確的層次結構。結構化數據可實現資源加工處理的標準化、智能化及可視化。(2)內容能夠隨時擴展。如采用HTML、CSSS3、OWL、DOI、CrossRef、ONIX等數字出版技術和標準,將分散的學術資源信息(如與根出版物相關的實驗過程、實驗數據、評價信息、參考文獻、相似文獻等)拓展為基于語義的智能網絡數據庫,達成用戶、學術資源和設備之間智能、無障礙的溝通與傳播。(3)必須能夠詳細、準確地記錄增補信息的相關內容(如標題、作者、修改日期、出版日期、文獻出處、文件類型、語義類型、DOI等),對其不同版本及其組成部分應詳細記錄與說明,便于編輯加工與控制出版內容,也方便讀者全面、清晰地了解與期刊內容相關的其他信息。(4)必須詳細記錄增強型出版物網絡資源間的關系,如包含關系、次序、版本、來源、表現形式、書目引用等。(5)增強型學術期刊的內容資源必須實現長期保存以及永久有效性,任何時候均可確定增強型出版物的組成部分,保證數據在若干年后的完整性與可獲取性。因此,對出版者而言,不僅要實現當下論文的易檢索、易獲取,更要保持數據信息多年后的可獲取性,實現數據的安全、有效、長久保存。在增強出版過程中,主要問題是如何使存儲在不同存儲庫的增強出版組成部分變為長久保存資料,為將來使用者提供完整的增強出版內容。由于增強出版內容保存在不同數據庫各數據庫具有自己的保存政策、法律、操作程序,這將影響倉儲中心控制其出版物。部分增強出版可能不在倉儲中心,而保存于網頁,所有者和管理者沒有清晰的定義[3]。這將給增強出版帶來一系列問題,增加長期保存與獲取難度。因此,只有解決數據資源的長期保存問題,學術資源的價值才能更為久遠地傳承下去。

3.3傳播

增強出版以“結構化文本+富數據”形式向讀者傳播數字化研究成果,讀者可通過搜索引擎,搜索相關內容,并分享到社交網絡,促進知識的發現。國外增強出版建設較成熟和完善,增強型學術期刊的傳播更有效與可互操作。如Nature、PLoS、Elsevier等均實現論文、增補內容等的結構化導航和鏈接,實現論文與任何類型數據的交互鏈接與增強顯示,相關內容均可分享到學術社區。論文結構化后實現導航閱讀功能,鏈接大量附加數據。增強論文PDF版還包含大量增強內容的標引符號,文后也有增補材料數據、數據列表或增補材料的在線網址等信息。對于增強內容,不同期刊的查看、下載方式也有差異。如Nature網頁中,針對擴展圖表的增強內容,點擊標引符號在當前頁面就可查看圖表,也可在其他頁面放大瀏覽、下載高清圖表,圖和表均為圖像格式,視頻可在線觀看或者下載,視頻有.mov、.mpg、.mp4等格式。Nature中的其他增補信息以及PLoS和Elsevier中的增補數據一般需要下載后才能查看,格式多樣,如Word、PDF、Zip、Excel等。不同期刊針對增補內容的標引符號也不相同,但一般包含S、Supplementary、Extended、Appendix等。基于國外經驗,增強型學術期刊在傳播過程中需確保:(1)必須能夠通過統一資源標識符(UniformResourceIdentifier,URI)來訪問根出版物及其組成部分;(2)必須確保能夠被讀者發現、傳播并利用。URI通過統一資源名稱與統一資源定位器來準確定位網絡資源,是訪問網絡資源的憑證。增強型學術期刊可利用URI定位資源,以保證資源的有序性和安全性。

4增強出版系統設計原則

要實現增強出版,須有相應的增強出版信息系統平臺。增強出版的主要動機是突破傳統科技論文限制來描述整個實驗活動的內容與產出,既要突破PDF的限制,支持科研成果數字化,自動獲取文獻和任何形式的研究成果(例如研究數據集),又要保持傳統出版傳播知識的敘事精神。因此,增強出版平臺的設計應堅持可讀性、易懂性、可鏈接到研究數據、使實驗具有可重復性等原則。增強出版信息系統平臺建設須適應數據時代知識服務的需求,注重頂層規劃與規范化設計,也要考慮不同類型消費者的需求,比如面對“計算機輔助的數據驅動知識發現”的新需求。Bardi等[1]研究不同增強出版平臺基于“組裝增補材料、提高可讀性和易懂性、鏈接研究數據、實驗能夠重復”4個目的的功能設計特征。Elsevier平臺在傳統期刊論文中鏈接增補材料,作者可上傳與論文相關的任何大小、格式的材料,如數據集、多媒體文件、大表格、動畫作品等。科研人員在線下載閱讀文章的同時,也可下載相關增補材料,有利于對論文的深度理解。PLoSNeglectedTropicalDiseases平臺上的論文富含語義鏈接,提供交互式表格、圖片、地圖等,提升讀者的閱讀體驗。SCOPE———科學數據復合對象的出版與采編系統,可讓作者輕松地創作、出版、編輯科學“復合對象”,是將數據集與科學實驗或發現過程中可更新、再利用的資源封裝成整體增強出版的過程,更加重視數據集被發現和重用,以及科研創作者合乎科學的回報。有些增強出版平臺要求的作者通過提供與論文相關數據的實現工具(如重復實驗過程的可執行工作流程),使科學家、評審人或公眾能更有效地評議論文及附加數據的質量。如SHARE信息系統通過創建遠程虛擬機映像(VirtualMachineImages,VMIs),展現和配置與出版論文有關的所有軟件和數據,科研人員無需下載安裝,直接在VMIs環境中確認、評價論文成果。

5結論

通過文獻調研和案例分析,在梳理增強出版概念、增強內容特征、實現流程及系統設計原則后,發現增強出版能促進傳統出版與數字出版的融合發展,優化期刊資源結構,深化期刊服務能力,強化知識給予。但需要對相關問題持續關注,深入探討增強出版模式、質量控制機制、數據的長久保存與共享、顯示鏈接方式等問題。作為傳播科學研究成果的主流媒介,我國科技期刊不僅要發揚傳統期刊傳播科學知識的歷史傳承,更要實施創新驅動戰略,以互聯網和大數據為支撐促進出版方式優化升級,使期刊承載更為豐富的信息,并以更智慧的方式傳遞科學知識。

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